El museo se puede visitar de lunes a viernes de 9 a 17 horas y los fines de semana entre las 12 a 18 horas. La duración de la visita es aproximadamente de dos horas, la visita se hace solo con guía, y tiene que se arreglada previamente por teléfono.
Durante la visita, se hace un recorrido dentro el edifico de la ex Escuela Mecánica de la Armada. El guía nos brinda informaciones sobre los objetivos del Museo y sobre su funcionamiento y dinámica, utilizando toda la documentación disponible para brindarnos detalles sobre la historia. Al final de la visita se puede recorrer unas exhibiciones que abordan, con perspectivas diferentes el terrorismo del estado en Argentina.